글 수 16

연구실 세미나를 아래와 같이 안내하니 많은 참석 바랍니다.

 

1. 일시 : 2014년 8월 5일 오전 11:00시

2. 장소 : 정문술빌딩 220호 강의실

3. 연사 : Kim Jae Kyoung (Ohio State University)

4. 제목 : Mathematics for complex and stochastic biochemical networks with disparate timescales

5. Abstract

The functions of living cells are regulated by the complex biochemical network, which
consists of stochastic interactions among genes and proteins. However, due to the
complexity of biochemical networks and the limit of experimental techniques, identifying
entire biochemical interaction network is still far from complete. On the other hand,
output of the networks, timecourses of genes and proteins can be easily acquired
with advances in technology. I will describe how to use oscillating timecourse data
to reveal biochemical network structure by using a fixed-point criteria. Moreover, I
will describe how mathematical modeling can be used to understand the dynamics
and functions of complex biochemical networks with an example of circadian clock.
Finally, in biochemical networks, reactions occur on disparate timescale. This timescale
separation has been used to project deterministic models of biochemical networks
onto lower-dimensional slow manifolds with quasi-steady state approximation (QSSA).
I will discuss whether this reduction technique for deterministic systems can be used
for stochastic systems. Specifically, I will show when macroscopic rate functions
derived with QSSA (e.g. Hill functions) can be used to derive the propensity functions of
microscopic rates for Gillespie algorithm.

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공지 BiS495 개별연구 주제공고 김태환 89103 249 2008-02-15
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연구실 세미나를 아래와 같이 안내하니 많은 참석 바랍니다. 1. 일시 : 2014년 8월 5일 오전 11:00시 2. 장소 : 정문술빌딩 220호 강의실 3. 연사 : Kim Jae Kyoung (Ohio State University) 4. 제목 : Mathematics for complex and stochastic bio...  
3 학부생연구원 모집 file 이황열 35782   2013-10-04
본 연구실에서는 시스템생물학(Systems Biology) 및 바이오영감공학(Bio-Inspired Engineering) 연구를 함께할 학부생연구원을 모집합니다. 바이오및뇌공학, 생물학, 전산학, 전자공학, 물리학, 수학 등 다양한 분야의 학부 3-4학년 학생들의 참여를 적극 권장...  
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1 SBIE에서 국비 석사 및 박사과정 학생들을 선발합니다. file 김태환 177719 55 2009-03-03
KAIST 바이오및뇌공학과 시스템생물학 및 바이오영감공학 연구실에서 생명과학과 공학/수학/물리학의 융합연구를 수행할 국비 석, 박사과정 학생 선발 KAIST 바이오및뇌공학과의 시스템생물학 및 바이오영감공학 연구실(Laboratory for Systems Biology...